Das ATV-Kontrollzentrum wird im Fermat-Gebäude des Toulouser Raumfahrtzentrums untergebracht. Für Einrichtung und Ausbau des Kontrollzentrums zeichnet die französische Raumfahrtagentur CNES verantwortlich, die im Auftrag der ESA auch alle ATV-Operationen vorbereitet, koordiniert und flankiert.